Fabia Battistuzzi

Fabia Ursula Battistuzzi
副教授
340 DH
(248) 370 - 3593
实验室位置:335B DH
实验室电话:(248)370-2658
battistu@www.zhongqiwg.com

课程:

生物3340进化生物学
生物4340进化医学原理
生物4342/5382进化生物学主题
功能基因组学和生物信息学
地球与生命的共同进化(实地课程)

研究方向:微生物生命进化的节奏和模式

我们所知道的生命具有惊人的多样性、适应力和适应地球上几乎任何环境的能力。然而，产生数十亿物种的进化速度(年表)和模式(进化机制)大多是未知的。巴蒂斯图齐博士的研究目的是了解物种是何时以及如何进化的，并调查它们的基因创新与环境条件变化之间的联系。在所有物种中，微生物跨越了地球历史上最长的时间，并且在代谢和生态上极其多样化。这些特征使它们成为研究长时间(数十亿年)和短时间(数百万年)进化机制的强大资源，同时追踪重要生态创新的起源，如致病性和传染病的起源。实验室主要项目包括:

• 原核生物的古代进化．原核生物(细菌和古生菌)以复杂的机制进化，阻碍了对它们的关系(系统发育)和起源时间(分子钟)的清晰理解。本研究项目的目的是提高我们对原核生物古代进化及其与行星尺度环境变化关系的理解。
  
  
• 传染病的起源和进化．许多真核微生物对人类和其他动物具有致病性，可引起疟疾等疾病。人们对这些疾病起源的古代知之甚少，因此，有利于它们传播到多个宿主的环境和生态环境存在很大争议。在这个项目中，我试图重建微生物病原体的历史，并利用这些信息来研究它们在遗传水平上的创新。
  
  
• 生物信息学工具的评估和开发．现有和即将到来的分子数据量需要重新评估当前的生物信息学工具，以评估它们对非常大的数据集的适用性、结果的准确性和计算需求。本研究项目的目标是为生物信息学工具的使用提供改进的指导方针，以解决已建立的研究领域，并开发新的工具，以满足不断增长的进化研究人员社区的需求。

这些独立开发的项目都推动了生物信息学的发展，而它们的协同效应将导致对生命进化史的更深入理解，这对理解当前和未来生物圈的变化至关重要。

选择出版物:

Fabia Battistuzzi NCBI出版名单

鲍威尔*，C.和F. u Battistuzzi。(2020)。在模拟环境中量化二级与远一级校准的误差。遗传学前沿11: 252。DOI:10.3389 / fgene.2020.00252 /满的．

Sitto*， F.和F.U. Battistuzzi。(2019)。用Roary估算泛基因组。分子生物学与进化:37(3): 933 - 939。DOI:10.1093 / molbev / msz284．

超人，A. a *， D.费伦*，A.德科维奇*和F.U.巴蒂斯图兹。(2019)。物种的选择影响深层节点的系统发育稳定性:terrabobacteria的一个经验例子．生物信息学35(19): 3608 - 3616。DOI:10.1093 /生物信息学/ btz121．

陶，Q, K.田村，F.U. Battistuzzi和S.库马尔。(2019)。一种机器学习方法，用于检测大系统发育中进化速率的自相关性。分子生物学与进化36: 811 - 824。DOI: 10.1093 / molbev / msz014．

杜庆华，陶志强，李志强*，田村强。(2018)。RelTime在整个系统发育过程中放松严格的分子钟。基因组生物学与进化10: 1631 - 1636。DOI:对10.1093 / gbe / evy118．

乔杜里，S.*， N. Lwin*， D. Phelan*， A.A. Escalante和F.U. Battistuzzi。(2018)。低复杂度区域的比较分析疟原虫．科学报告8: 335。DOI: 10.1038 / s41598 - 017 - 18695 - y．

Marin, F.U. Battistuzzi, A.C. Brown*和B. Hedges。(2018)。原核生物的时间树:对其进化和物种形成的新见解。分子生物学与进化34: 437 - 446。DOI:10.1093 / molbev / msw245．

Battistuzzi, f.u.， K. Schneider, M.K. Spencer, D. Fisher, S. Chaudhry*和A.A. Escalante。(2016)。apiccomplexa中低复杂度区域的剖面。BMC进化生物学16:47。DOI: 10.1186 / s12862 - 016 - 0625 - 0．

*你的学生