长刺海胆
2022年12月5日
奥克兰大学的一组研究万博ManBetX登录人员发表了第一个完整的线粒体基因组的Diadema antillarum俗称长刺海胆。这种无脊椎海洋食草动物生活在西大西洋和加勒比海的浅海，具有重要的生态功能:以该地区珊瑚礁附近的藻类为食，防止过度生长，从而威胁到珊瑚礁及其所支持的生物多样性。海洋中大约四分之一的鱼类依赖珊瑚礁作为栖息地，这使得长刺海胆的反复死亡尤其令人不安。该物种在20世纪80年代和90年代以及今年经历了死亡事件，死亡率达到90-95%。
“还有其他种类的海胆栖息并与生态位重叠Diadema antillarum但只有这个物种遭受了大规模的死亡事件。在这段时间里，没有其他紧密居住或同居的物种死亡，”奥黛丽·j·梅奎克博士说，她是OU生物科学系的特别讲师，也是该研究的主要作者。“这是收集该物种遗传信息的一个关键原因，这样我们就可以设计研究来了解为什么这个物种继续遭受死亡事件，以及如何保护它免受未来可能发生的事件的影响，特别是如果它们是由人类活动引起的。”
珊瑚礁还为人类社区提供了许多好处，为海岸线提供了抵御飓风的保护，并吸引了数百万游客使用珊瑚礁进行娱乐。根据自然保护协会的说法，加勒比海地区与珊瑚礁相关的旅游业每年产生80亿美元。
梅奎克博士与俄勒冈大学生物科学系的博士生斯蒂芬妮·o·卡斯特罗(Stephanie O. Castro Márquez)和沃尔特·沃尔夫斯堡(Walter Wolfsberger)合作进行了这项研究。OU生物学教授Taras K. Oleksyk博士是该项目的首席研究员，该项目始于他和mehke博士在马亚圭斯的波多黎各大学任教时。这项研究以英语、西班牙语和乌克兰语三种语言发表在开放获取的期刊《GigaByte》上。
Oleksyk博士说:“除了主要的英语版本外，还在网上发布了西班牙语的第二个版本，以使这些发现能够提供给收集海胆样本的岛上(波多黎各)说西班牙语的观众。”“这篇论文的乌克兰版本也发表了，以表明该杂志与乌克兰在战争中的斗争团结一致。”
的基因组测序Diadema antillarum研究人员还发现了另一种长刺海胆，Diadema savignyi在科学文献中被错误识别。弄清楚这个错误的身份将有助于研究人员更好地了解和记录海胆在世界各地的分布。大约有950种已知的海胆物种，它们栖息在世界各地海洋的各种气候条件下的广泛深度地带。
“海胆是非常古老的动物。自大约4.5亿年前的奥陶纪以来，它们就已经存在了，并在多次大灭绝中幸存下来，”迈奎克博士说。“了解它们的分布不仅为近代历史提供了背景，还有助于从地质和进化的角度看待地球的生物多样性。”
除了她在这项研究中的工作外，majesty博士还将海胆基因组作为学生在她的课程中接受的实践指导的一部分。学生们研究了16种基因太平洋紫海胆（Strongylocentrotus purpuratus)，比较和对比它们在不同样本中的表达，以了解基因表达水平如何在生物体的生命中发生变化。这项研究的发现将有助于为学生设计未来的研究，并为专业研究人员的工作提供信息。
“学生可以获得执行科学方法步骤的实践经验，包括数据收集和分析、假设检验和得出结论。这种方法增强了学生的学习能力，因为它推动了批判性思维，”majesty博士说。“它能引导学生把这些点联系起来，并理解他们为什么会得出这些结论。这就是在任何科学领域推动研究和创造新知识的动力。”